Juan de Betanzos llegó a Perú con Francisco Pizarro y tras las múltiples peripecias políticas y guerreras de la época y el lugar, llegó a ser intérprete del segundo Gobernador del Perú, Cristóbal Vaca de Castro y luego colaboró con el enviado de la corona para sofocar la rebelión de los Pizarro, Pedro de la Gasca, el mismo personaje que al fin nombrara Gobernador de Chile a Pedro de Valdivia. Actuó como mediador durante la revolución incaica centrada en Vilcabamba.
Tomó por esposa a Angelina, hija de Wayna Qhapac, descendiente de Tupaq Yupanki, quien antes había sido concubina de Francisco Pizarro, habiendo desplazado a su hermanastra Inés Yupanki de su rol de favorita de Pizarro y dándole a éste dos hijos varones. En 1551 escribió su obra “Suma y Narración de los Incas”, la que sólo se editó 300 años después.